Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms