Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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USP18Q9UMW8 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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USP18Q9UMW8 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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USP18Q9UMW8 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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USP18Q9UMW8 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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