Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CTXN3Q4LDR2 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTXN3Q4LDR2 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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