Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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