Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 YWHABP1-201ENST00000445359 727 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SCN5A-203ENST00000413689 8504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GK5-201ENST00000392993 9837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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