Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms