Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ATP1A4Q13733 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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ATP1A4Q13733 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ATP1A4Q13733 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ATP1A4Q13733 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ATP1A4Q13733 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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ATP1A4Q13733 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ATP1A4Q13733 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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