Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms