Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNA5SP74-201ENST00000363538 109 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 NUPR1-202ENST00000395641 550 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC015977.2-201ENST00000420852 567 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 UBE2Q1-AS1-201ENST00000441613 432 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AP005597.3-201ENST00000532369 799 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MIR6751-201ENST00000610479 63 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CALD1-202ENST00000361901 4114 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 NCAM1-221ENST00000615112 5967 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF185-212ENST00000539731 4334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC009948.1-205ENST00000453026 2007 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TCL6-207ENST00000483087 2194 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AKAP13-217ENST00000560302 3765 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LRRC2-202ENST00000395905 5100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GRIA3-209ENST00000622768 5173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 KIAA0391-205ENST00000603544 2232 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF35-201ENST00000296092 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SMAD9-203ENST00000399275 5389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GSDMC-201ENST00000276708 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SLC30A8-201ENST00000427715 5430 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CCT8-212ENST00000626972 1862 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RHBDD1-202ENST00000392062 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 KIZ-AS1-203ENST00000616177 5370 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RNA5SP250-201ENST00000362534 119 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC012462.3-201ENST00000412951 131 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RPSAP8-201ENST00000429844 889 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC156455.1-202ENST00000540968 587 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC012186.1-201ENST00000566702 398 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC005614.2-201ENST00000595508 461 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.176-201ENST00000619772 282 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 XRCC6P4-201ENST00000518193 2067 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 FAM9C-201ENST00000333995 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CARD8-216ENST00000520153 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CRIPT-201ENST00000238892 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 USP17L26-202ENST00000610514 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 USP17L20-202ENST00000613757 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MKRN4PQ13434 USP17L11-202ENST00000613973 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms