Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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