Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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