Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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