Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LMAN2Q12907 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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