Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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