Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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CASQ1P31415 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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CASQ1P31415 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CASQ1P31415 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CASQ1P31415 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CASQ1P31415 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CASQ1P31415 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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CASQ1P31415 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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CASQ1P31415 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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