Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.5 ms