Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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SH3BP1Q9Y3L3 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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