Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms