Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CACNA1SQ13698 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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