Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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CDH18Q13634 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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CDH18Q13634 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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