Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms