Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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