Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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