Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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