Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms