Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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GPS1Q13098 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GPS1Q13098 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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