Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ZNF778-201ENST00000306502 2386 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ENY2-211ENST00000521688 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ZNF502-204ENST00000449836 3173 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 AC105760.1-201ENST00000244820 2231 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 ZNF610-207ENST00000601151 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TMEM144-216ENST00000514558 3699 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 CTNNA2-217ENST00000540488 2792 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC139256.1-201ENST00000569858 2598 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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MKRN3Q13064 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ELF5-201ENST00000257832 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ADGRF1-201ENST00000283297 2142 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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