Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PGGT1BP53609 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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