Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms