Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms