Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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USP18Q9UMW8 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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USP18Q9UMW8 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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