Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BIN2-202ENST00000544402 1990 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-V-203ENST00000457107 4814 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND2-205ENST00000503622 2982 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EPX-201ENST00000225371 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PYGL-205ENST00000532462 2711 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC21-201ENST00000380916 9160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFIP1-201ENST00000353617 3111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL2-202ENST00000374748 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP30-202ENST00000368015 3887 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ABI1-201ENST00000346832 3289 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEK-201ENST00000234313 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00598-207ENST00000616706 2088 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF1-208ENST00000419524 683 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL186P-201ENST00000466485 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRE-207ENST00000471218 522 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL12P38-201ENST00000471280 490 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL386P-201ENST00000485776 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms