Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms