Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms