Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPS20P23-201ENST00000461683 354 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MIR4664-201ENST00000583819 71 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 C2orf83-204ENST00000641422 291 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms