Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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