Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 PIK3C2B-202ENST00000367187 7686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 COL11A1-201ENST00000353414 7173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 OR8J1-201ENST00000303039 1074 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 ZNF765-206ENST00000594030 7588 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 UNC5C-201ENST00000453304 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RYR3Q15413 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms