Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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PUM3Q15397 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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PUM3Q15397 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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PUM3Q15397 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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