Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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CHD4Q14839 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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CHD4Q14839 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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CHD4Q14839 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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CHD4Q14839 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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