Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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