Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms