Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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SOX4Q06945 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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SOX4Q06945 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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