Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLTCQ00610 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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