Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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PTPRGP23470 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
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PTPRGP23470 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
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