Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms