Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CLDN9O95484 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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CLDN9O95484 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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CLDN9O95484 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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CLDN9O95484 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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CLDN9O95484 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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CLDN9O95484 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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CLDN9O95484 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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CLDN9O95484 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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CLDN9O95484 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLDN9O95484 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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