Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 C14orf177-201ENST00000325812 1284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LINC00587B1AMM8 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms