Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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CCSER1Q9C0I3 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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CCSER1Q9C0I3 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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