Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC124045.1-201ENST00000606008 1953 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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