Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms